1. Pengajuan Makalah
Penulis korespondensi atau penulis yang mengirimkan makalah ke jurnal. Pengajuan ini dilakukan melalui sistem daring yang didukung oleh Open Journal System (OJS). Namun, untuk memudahkan penulis, JIE untuk sementara juga menerima pengajuan makalah melalui surel.

2. Penilaian Redaksi
Makalah yang dikirimkan akan dinilai terlebih dahulu oleh editor JIE. Editor akan memeriksa kesesuaiannya dengan fokus dan cakupan Jurnal. Komposisi dan tata letak makalah dievaluasi berdasarkan Pedoman Penulis jurnal untuk memastikan makalah tersebut mencakup bagian dan stilisasi yang dipersyaratkan. Selain itu, penilaian kualitas minimum makalah yang dipersyaratkan untuk publikasi dimulai pada langkah ini, termasuk penilaian untuk melihat apakah terdapat cacat metodologis yang signifikan. Setiap makalah yang lolos langkah ini akan diperiksa oleh Turnitin untuk mengidentifikasi plagiarisme sebelum ditinjau oleh para peninjau.

3. Penilaian oleh Pemimpin Redaksi
Pemimpin Redaksi memeriksa apakah makalah tersebut sesuai untuk jurnal, cukup orisinal, menarik, dan signifikan untuk dipublikasikan. Jika tidak, makalah tersebut dapat ditolak tanpa peninjauan lebih lanjut.

4. Undangan untuk Peninjau
Editor yang menangani mengirimkan undangan kepada individu yang ia yakini akan menjadi peninjau yang tepat (juga dikenal sebagai wasit) berdasarkan keahlian, kedekatan minat penelitian, dan tidak adanya pertimbangan konflik kepentingan. Proses peer-review di JIE melibatkan komunitas pakar di bidang pendidikan Islam yang didefinisikan secara sempit sebagaimana tercantum dalam fokus dan ruang lingkup yang memenuhi persyaratan dan mampu melakukan review yang cukup imparsial. Imparsialitas ini juga dipertahankan oleh peer review double-blind yang diterapkan dalam jurnal ini. Meskipun demikian, reviewer tidak mengetahui identitas penulis, dan sebaliknya, penulis tidak mengetahui identitas reviewer. Makalah dikirimkan kepada reviewer secara anonim.

5. Tanggapan atas Undangan
Calon reviewer mempertimbangkan undangan tersebut berdasarkan keahlian mereka sendiri, konflik kepentingan, dan ketersediaan. Mereka kemudian memutuskan untuk menerima atau menolak. Dalam surat undangan, editor dapat meminta calon reviewer untuk menyarankan reviewer alternatif, jika ia menolak untuk mereview.

6. Review Dilakukan
Para reviewer mengalokasikan waktu untuk membaca makalah beberapa kali. Pembacaan pertama digunakan untuk membentuk kesan awal terhadap karya tersebut. Jika ditemukan masalah besar pada tahap ini, para reviewer dapat dengan mudah menolak makalah tersebut tanpa perlu melakukan riset lebih lanjut. Jika tidak, mereka akan membaca makalah tersebut beberapa kali lagi, mencatat untuk membangun tinjauan poin demi poin yang terperinci. Tinjauan tersebut kemudian diserahkan ke jurnal, dengan rekomendasi untuk menerima, atau menolaknya, atau dengan permintaan revisi (biasanya ditandai sebagai mayor atau minor) sebelum dipertimbangkan kembali.

7. Jurnal Mengevaluasi Tinjauan
Pemimpin Redaksi dan editor yang menangani mempertimbangkan semua tinjauan yang dikembalikan sebelum membuat keputusan keseluruhan. Jika tinjauan sangat berbeda antara kedua peninjau, editor yang menangani dapat mengundang peninjau tambahan untuk mendapatkan pendapat tambahan sebelum membuat keputusan.

8. Keputusan Dikomunikasikan
Editor mengirimkan surel keputusan kepada penulis termasuk komentar peninjau yang relevan. Komentar peninjau dikirim secara anonim kepada penulis yang sesuai untuk mengambil tindakan dan tanggapan yang diperlukan. Pada tahap ini, peninjau juga akan dikirimi surel atau surat yang memberi tahu mereka hasil tinjauan mereka.

9. Langkah Akhir
Jika diterima, makalah dikirim ke tahap penyuntingan naskah. Jika artikel ditolak atau dikembalikan kepada penulis untuk revisi mayor atau minor, editor yang menangani akan menyertakan komentar konstruktif dari para peninjau untuk membantu penulis memperbaiki artikel tersebut. Penulis harus melakukan koreksi dan merevisi makalah sesuai dengan komentar dan instruksi peninjau.

Setelah revisi dilakukan, penulis harus mengirimkan kembali makalah yang telah direvisi kepada editor.

Jika makalah dikembalikan untuk direvisi, para peninjau akan menerima versi revisinya, kecuali mereka telah memilih untuk tidak berpartisipasi lebih lanjut. Namun, jika hanya ada sedikit perubahan yang diminta, peninjauan lanjutan ini dapat dilakukan oleh editor yang menangani.

Jika editor puas dengan makalah yang telah direvisi, makalah tersebut dianggap diterima. Makalah yang diterima akan dipublikasikan secara daring dan semuanya tersedia gratis sebagai berkas PDF yang dapat diunduh.